我系从教学计划的制订（修订）、教学内容的补充、实践教学环节的加强等方面进行了初步的改革尝试。通过对社会、用人单位所作的广泛的调研论证，在借鉴兄弟高校相关专业建设成功经验的基础上，调整和完善了生物技术专业的人才培养方案，修订了教学计划，同时更加注重基础教学和素质教育，对课程设置、教学时数等方面都进行了调整，增加了专业选修课与实践课程的比例，旨在培养学生的专业能力和创新精神。

目前已建成《有机化学》、《微生物学》和《食品工艺学》三门福建省级精品课。